DNA triipkoodimise teenus

Elurikkuse ja selle muutuste kirjeldamiseks on vajalik organisme võimalikult täpselt ning aja- ja kulutõhusalt määrata. Tänapäeval tugineb see valdavalt molekulaarsetele meetoditele, millest levinuim on valitud geenilõikude järjestamine ja DNA-järjestuste võrdlus andmebaasides talletatuga ehk DNA triipkoodimine.

TÜ loodusmuuseumi DNA triipkoodimise labor pakub koos Tartu Ülikooli ökoloogia ja maateaduste instituudiga liikide molekulaarse määramise teenust kõigile huvitunutele, mh Eesti loodusteaduslikele kogudele, taksonoomia, ökoloogia, liikide registreerimise ja seire, aga ka taimekaitse ja meditsiini valdkonnas tegelevatele uurimisrühmadele, asutustele ning harrastajatele Eestis ja kogu maailmas.

Koostöö loodusmuuseumi elurikkuse digiarhiivide töörühmaga tagab molekulaarlabori töövoo digitaalse dokumenteerimise ning võimaluse DNA järjestuste ja nende metaandmete talletamiseks ühises andmeruumis PlutoF. Pakkudes lahendusi organismide molekulaarseks määramiseks ja DNA-põhiste esinemiskirjete avaldamiseks andmeportaalides eElurikkus ja GBIF, aitab koostöö kaasa DNA triipkoodide kvaliteetse võrdlusandmestiku täiendamiseks nii Eestis kui ka mujal. Tänu laborile osaleb Eesti ka rahvusvahelistes koostöövõrgustikes, nt maailma eluslooduse triipkoodimise konsortsiumis (iBOL, https://www.ibol.org).

Pakutavad teenused:

Võtame vastu erinevat tüüpi materjali: organismid, nende osad, koeproovid nii värskel kui ka erineval moel säilitatud kujul.

Võimalik on tellida erinevat tüüpi analüüse:

  • DNA eraldamine;
  • ühe või mitme geenilõigu amplifitseerimine (PCR);
  • DNA järjendamine;
  • DNA järjestuste alusel organismi määramine;
  • DNA järjestuste ja proovide leiuandmete andmebaasi kandmine;
  • DNA-põhise taksoni esinemise kirje avaldamine.

Kõikide etappide kohta esitatakse tellijale kirjalik aruanne.

Kontakt

Töö hind sõltub määramiseks antavate proovide olemusest (vanus, seisund jne), millest lähtuvalt valitakse sobiv DNA eraldamise ja PCR-i meetod. Suurema arvu proovide analüüsimisel on ühe proovi hind väiksem kui üksikute proovide käitlemisel.

Hinnakiri

  1. 1–24 proovi: 30 eurot + km / proov; iga järgnev geen samast proovist maksab lisaks 5 eurot + km
  2. 25–96 proovi: 25 eurot + km / proov; iga järgnev geen samast proovist maksab lisaks 5 eurot + km
Teenuse kasutamiseks ja hinnapakkumise saamiseks palume võtta ühendust e-kirja teel: [email protected].